Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms