Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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