Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms