Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms