Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PrkcaP20444 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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