Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NefhP19246 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NefhP19246 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
NefhP19246 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NefhP19246 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms