Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Clip3B9EHT4 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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