Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms