Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
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Rabgef1Q9JM13 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rabgef1Q9JM13 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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