Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Smg9Q9DB90 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms