Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Usp12Q9D9M2 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Usp12Q9D9M2 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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Usp12Q9D9M2 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Usp12Q9D9M2 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Usp12Q9D9M2 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp12Q9D9M2 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms