Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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