Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms