Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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