Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Actn1Q7TPR4 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Actn1Q7TPR4 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms