Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxa13Q62424 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.6 ms