Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms