Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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