Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shank3Q4ACU6 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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