Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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