Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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Rnf149Q3U2C5 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnf149Q3U2C5 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnf149Q3U2C5 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnf149Q3U2C5 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnf149Q3U2C5 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnf149Q3U2C5 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf149Q3U2C5 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Rnf149Q3U2C5 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Rnf149Q3U2C5 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rnf149Q3U2C5 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rnf149Q3U2C5 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rnf149Q3U2C5 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rnf149Q3U2C5 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Rnf149Q3U2C5 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rnf149Q3U2C5 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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