Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms