Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpusd3Q14AI6 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms