Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms