Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms