Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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