Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms