Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms