Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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