Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms