Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Atg3Q9CPX6 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Atg3Q9CPX6 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg3Q9CPX6 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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