Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Atg4aQ8C9S8 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Atg4aQ8C9S8 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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