Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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NischQ80TM9 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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NischQ80TM9 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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NischQ80TM9 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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NischQ80TM9 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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NischQ80TM9 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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NischQ80TM9 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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NischQ80TM9 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NischQ80TM9 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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