Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms