Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Usp48Q3V0C5 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Usp48Q3V0C5 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms