Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28451-201ENSMUST00000189311 2560 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms