Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ttc39dQ0VF76 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ttc39dQ0VF76 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ttc39dQ0VF76 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms