Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pkp1P97350 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pkp1P97350 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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