Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Nedd1P33215 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms