Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms