Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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