Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hdac6Q9Z2V5 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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Hdac6Q9Z2V5 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hdac6Q9Z2V5 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hdac6Q9Z2V5 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hdac6Q9Z2V5 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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