Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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