Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Smg9Q9DB90 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Smg9Q9DB90 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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