Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccer1Q9CQL2 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms