Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubxn4Q8VCH8 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms