Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CtifQ6PEE2 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms