Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CltcQ68FD5 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms