Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Rbbp4Q60972 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Rbbp4Q60972 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rbbp4Q60972 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rbbp4Q60972 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rbbp4Q60972 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms