Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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